配合國家淨零排放政策，本所積極推動海洋碳匯與藍碳資源研究，致力發展海草與大型藻類復育技術，並完成澎湖、屏東墾丁、嘉南廢棄鹽田及臺東富山資源保育區等具潛力場域盤點，總計達300公頃，逐步建構海洋增匯示範體系。同時結合地方創生與社區經營，廣邀公部門、在地社區、學校及媒體共同參與海草床復育行動，擴大社會影響力。迄今已透過ESG理念及MOU合作機制，串聯澎湖縣府、臺東區漁會及多家企業與學研單位，形塑跨域協力典範。本所推動之「許海洋生物一個家－澎湖海草床復育公私協力共創三贏」計畫，榮獲農業部第8屆政府服務獎優等肯定，展現政策推動與社會共創之具體成果。
